Apa itu "Reporter Gene"?

-


Apa itu Gen Reporter?

Dalam biologi molekuler, gen reporter (seringkali hanya reporter) adalah gen yang digunakan oleh peneliti dalam bidang biologi molekuler sebagai penanda apakah gen tertentu telah berhasil diekspresikan oleh suatu sel atau populasi organisme. 

Untuk meneliti gen tertentu, ketika membuat DNA rekombinan, peneliti menggabungkan gen reporter pada urutan regulator ge yang ingin diteliti pada sel bakteri, tumbuhan, maupun hewan. 

Jadi,  untuk memasukkan gen tertentu pada tubuh suatu organisme, para ilmuwan akan menempatkan gen reporter dan gen yang ingin dimasukkan tersebut pada satu molekul DNA yang sama, sehingga dapat dimasukkan secara bersama-sama ke dalam sel. 

Penting untuk menggunakan reporter gene yang secara alami tidak diekspresikan oleh organisme tersebut. Dengan demikian, ketika organisme mampu menunjukkan kehadiran produk reporter gene, hal tersebut mengindikasikan bahwa gen yang dimasukkan ke tubuh organisme tersebut berhasil. 


Apasaja jenis Reporter Gene yang umum digunakan?

Gene reporter yang umum digunakan merupakan gen yang dapat menghasilkan karakteristik yang dapat diamati secara visual. karena itu, produk gen reporter ini umumnya berupa molekul yang dapat berpendar (flourescent). Beberapa contoh gen reporter, yaitu: 

1. GFP (Green Flourescent Protein), menyebabkan sel yang mengekspresikannya dapat berwarna hijau jika diberi cahaya biru (glow under blue light)

2. GUS, gen yang umumnya digunakan sebagai reporter gene pada tanaman.

3. Gen Lac-Z, merupakan gen pada bakteri yang menyandi Beta-galaktosidase. Bakteri yang mengekspresikan gen Lac-Z ini berwarna biru jika ditumbuhkan pada medium yang mengandung X-gal. 

4. Gen CAT (Chloramphenicol acyltransferase), umum digunakan pada bakteri, menyebabkan resistensi pada antibiotik chloramphenicol. 


Bagaimana cara agar dapat mengekspresikan gen asing pada sel suatu organisme?

Ada dua cara utama untuk mengekspresikan gen asing atau gen yang telah dimodifikasi pada sel organisme, yaitu:

1. Transfeksi

2. Transformasi.


Ketika melakukan transfeksi atau transformasi, hanya sedikit dari populasi sel yang akan benar-benar berhasil menerima gen asing atau gen yang telah dimodifikasi oleh peneliti. Karena itu, penting untuk dapat mengidentifikasi sel mana yang berhasil.

Gen reporter yang digunakan sebagai indikator keberhasilan transformasi umumnya diekspresikan dengan menggunakan promoter mereka sendiri, berbeda dengan promoter yang digunakan oleh gen yang ingin diteliti (gene of interest). Gen reporter dapat diekspresikan secara terus-menerus (always ON) atau melalui induksi (seperti pada induksi IPTG /  Isopropyl β-D-1-thiogalactopyranoside pada sistem beta-galaktosidase).  Karena memiliki promoter sendiri, maka gen reporter ini independen dari gen of interest, yang dapat menguntungkan jika gene of interest hanya diekspresikan pada kondisi tertentu.  





Komentar

Posting Komentar

Postingan populer dari blog ini

Mie Instan

-
Sejak duduk di bangku sekolah dasar, mie instan sudah termasuk dalam daftar makanan "terlarang" untuk saya, termasuk untuk adik saya. Bukan karena kami tidak suka, tetapi karena ibu melarangnya. Bukannya menghentikan konsumsi mie instan,  kami malah semakin penasaran. Tak jarang  kami makan mie instan tanpa sepengetahuan ibu.  Apa cuma kami yang masa kecilnya dilalui dengan makan mie  mentah sembunyi-sembunyi? Di bangku kelas lima sekolah dasar (SD), indomie goreng mentah adalah salah satu menu favorit saat istirahat. Satu bungkus indomie goreng harganya sekitar seribu rupiah, dengan kemasan yang masih persis sama dengan yanga beredar di pasaran saat ini. Untuk mengolah mie instant ini, kami tidak perlu panci, air, dan kompor untuk merebus. Pengolahan ala anak seusia kami saat itu bahkan lebih instant dari yang ditampilkan disaran penyajian, cukup dengan mengepalkan tangan lalu memberi tekanan berupa tumbukan berkali-kali hingga mie instant yang masih terbungkus rapat i
Baca selengkapnya

PERBANDINGAN ANATOMI DAUN TANAMAN C3 DAN C4

-
Gambar
Fotosintesis merupakan serangkaian proses untuk mengubah energi cahaya (foton) menjadi energi kimiawi (karbohidrat). Proses fotosintesis pada tumbuhan utamanya berlangsung pada sel-sel parenkim palisade yang banyak mengandung kloroplas. Secara umum, proses fotosintesis pada tumbuhan berlangsung melalui dua tahapan utama, yaitu: (1) Reaksi terang di membran luar tilakoid, dan (2) reaksi gelap atau Siklus Calvin di stroma. Reaksi terang ( Light dependent reaction ) merupakan proses untuk mengubah energi cahaya menjadi energi kimia berupa ATP dan NADPH. Energi dari ATP dan NADPH inilah yang selanjutnya digunakan sebagai sumber energi dalam reaksi gelap ( Light independent reaction ) . Reaksi gelap yang berlangsung di stroma merupakan proses yang tidak bergantung cahaya. Meskipun namanya reaksi gelap, bukan berarti reaksi gelap ini berlangsung pada kondisi gelap atau pada malam hari. Reaksi ini dapat berlangsung jika sudah tersedia ATP dan NADPH dari reaksi terang dan
Baca selengkapnya

Pesan Inspiratif dari Tiga Film Favorit

-
Gambar
"Kak Citra, suka baca novel atau nonton film?" "Kalau ada novel yang difilmkan? Lebih suka baca novelnya, sih." "Kenapa?" "Ya, karena novel selalu lebih detail. Tidak semua hal dari novel bisa dimasukkan ke film, kan?" Membaca potongan percakapan itu, kalian mungkin berpikir saya benar-benar suka membaca novel. Tidak juga. Kenyataannya, saya hanya membaca novel-novel  best seller yang direkomendasikan teman atau novel yang diangkat menjadi film. Dibandingkan novel, saya lebih bisa bercerita banyak soal film, meskipun belum bisa disebut penggemar film garis keras.  Di sekeliling, banyak teman yang hobi nonton dan mengulas film. Ada yang menuliskan ulasannya di blog, ada juga yang membagikan di sosial media. Kalau mereka memberi rate 9/10 atau 10/10, saya biasanya baru tertarik untuk nonton film itu. Hehe. Nah, dari semua film yang saya tonton, ada satu pertanyaan yang harus terjawab, "Pesan apa yang ingi
Baca selengkapnya